События разворачиваются в 1889 году, через 13 лет после государственного переворота в королевстве Тортес. В ходе переворота было уничтожено оружие под названием Вавилонская Башня, управляемое артефактом Голубая Вода. Это оружие обладало способностью уничтожать всё живое на больших территориях. Гибель оружия привела к краху королевства. Выжившие жители разделились на две враждующие секретные организации. Первая организация, Нео-Атлантис, возглавляется бунтовщиками при поддержке императора Нео.